В центре истории — начинающие ниндзя, только что окончившие академию. Их ждут опасные ситуации...
За двенадцать лет до начала основных событий, Девятихвостый атаковал Деревню Скрытого Листа, уничтожив бóльшую часть деревни и унеся множество жизней. Лидер деревни, Четвёртый Хокаге, принёс себя в жертву, чтобы запечатать Девятихвостого в новорождённом мальчике — Наруто Узумаки. Осиротевшего, по причине нападения, Наруто избегали жители деревни, которые из чувства страха и злости видели в нём самого Девятихвостого.
Несмотря на то, что Третий Хокаге запретил говорить обо всём, что касалось Девятихвостого, дети ментально перенимали свою неприязнь от родителей, и, тем самым, унаследовали враждебность по отношению к Наруто (Naruto). Желая быть признанным, Наруто поклялся однажды стать величайшим Хокаге, которого видела деревня.
