Много невзгод и проблем встретил Наруто Узумаки – великий ниндзя. Прошли экзамены на повышение квалификации, прошли долгие годы, где горечь и боль, с переменным успехом, заменились на радость и счастье. Наруто стал взрослее, умнее, быстрее и сильнее. Предательство за предательством его закалили, а его настоящие друзья определились в беде. Теперь, после двух лет обучения у знаменитого на весь мир отшельника Джирайя, Узумаки готов к новым приключениям, ведь грядет новая эра.

К тому же, каждый из тех, кто окружал Наруто в его нелегком деле – выпускники школы ниндзя – тоже прошли квалификацию и кто-то стал тюнином или дзенином. К тому же, теперь они ученики трех великих санинов. Сакура стала работать под предводительством мадам Цунадэ, а Саскэ стал работать с Орочимару. Постепенно, всплывают старые тайны, которые мешают жить нормально. Надежда все еще есть, но грядет что-то более ужасающее – война синоби.