«Доктор Стоун» — захватывающая история о возрождении человечества, где наука становится ключом к спасению мира. В центре повествования находится Сэнку Ишигами, гениальный молодой учёный, очнувшийся через 3700 лет после загадочного явления, превратившего всё человечество в камень. Обладая энциклопедическими знаниями и несгибаемой волей, он начинает грандиозный проект по восстановлению цивилизации с нуля, используя научные методы. После пробуждения своего физически сильного друга Тайдзю, они вместе начинают долгий путь к возрождению человечества, сталкиваясь с вызовами первобытного мира и противостоянием различных идеологий.